home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Shareware Overload Trio 2 / Shareware Overload Trio Volume 2 (Chestnut CD-ROM).ISO / dir26 / med9407f.zip / M9471075.TXT < prev    next >
Text File  |  1994-08-09  |  3KB  |  46 lines
  1.        Document 1075
  2.  DOCN  M9471075
  3.  TI    Alternative dna structures in topoisomerase II-DNA interactions.
  4.  DT    9409
  5.  AU    Howard MT; Univ. of North Carolina at Chapel Hill
  6.  SO    Diss Abstr Int [B]; 53(9):4481 1993. Unique Identifier : AIDSLINE
  7.        ICDB/94690788
  8.  AB    The type II DNA topoisomerases are enzymes that can change the
  9.        topological state of DNA. This is accomplished by passing DNA strands
  10.        through each other via a transient break in the helix. The result of
  11.        this reaction is to relax or introduce DNA supercoils and to resolve
  12.        knotted or catenated DNAs. Topoisomerase activity is essential for many
  13.        aspects of DNA metabolism such as transcription which generates waves of
  14.        DNA supercoiling and replication that produces catenated daughter DNAs.
  15.        Several compounds that inhibit topoisomerase II are highly toxic to
  16.        actively replicating cells and have been used as anti-tumor agents.
  17.        These inhibitors act by trapping a topoisomerase II-DNA complex at the
  18.        cleavage step of the catalytic cycle. DNA cleavage can be captured by
  19.        exposing the complexes to a protein denaturants such as SDS. Analysis of
  20.        the cleavage products reveals that topoisomerase II acts at specific
  21.        locations on the DNA with some sequence preferences. In this study we
  22.        report that alternative DNA structures can affect topoisomerase II-DNA
  23.        interactions. A strong binding site for Drosophila topoisomerase II was
  24.        created by a sequence directed DNA bend. The shape of the bend brings
  25.        two distant DNA segments into close proximity creating a DNA crossover
  26.        or node. Because topoisomerase II binds two DNA segments simultaneously
  27.        it preferentially localizes to this structure. In the absence of a fixed
  28.        DNA crossover, topoisomerase II captures two DNA segments by random
  29.        collision. DNA gyrase, the type II topoisomerase from E coli, did not
  30.        recognize this structure although it did bind two DNA segments
  31.        simultaneously via a random collision event. We have identified a
  32.        cluster of strong topoisomerase II sites which map to a complex repeated
  33.        sequence element flanking the HIV isolate HXB2. This region is capable
  34.        of forming slipped pairing structures, cruciforms, or Z-DNA. We conclude
  35.        that topoisomerase II-DNA interactions can be affected by DNA structure
  36.        in addition to the primary sequence of DNA. (Full text available from
  37.        University Microfilms International, Ann Arbor, MI, as Order No.
  38.        AAD93-02534.)
  39.  DE    Animal  Binding Sites  DNA/CHEMISTRY/*METABOLISM  DNA Topoisomerase
  40.        (ATP-Hydrolysing)/*METABOLISM  Drosophila  Escherichia coli/ENZYMOLOGY
  41.        Nucleic Acid Conformation  THESIS
  42.  
  43.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  44.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  45.  
  46.